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文獻解讀

集思慧遠客戶發表《寶華玉蘭完整質體基因組及木蘭科植物的遺傳比較》

幸运飞艇官方开户FABURIQI:2019-03-08 LIULANCISHU:580



  寶華玉蘭是一種極度瀕危物種,僅存于中國江蘇省寶華山有18棵。關于它的分子生物學的信息很少,直到現在還沒有對寶華玉蘭進行質體基因組研究。本文通過對寶華玉蘭(Magnolia Zenii)的完整葉綠體基因組進行測序組裝,鑒定SSR,并通過對近緣物種基因組結構和序列數據的比較分析,揭示了5個突變熱點,對今后木蘭科的系統發育和進化研究具有重要意義。

這篇文章的研究內容如下:

1.葉綠體基因組組裝

寶華玉蘭基因組長160,048 bp,GC含量為39.2%,包括一對26,596 bp的反向重復區(IRA和IRB),一個大單拷貝區(LRC)88,098 bp,一個小單拷貝區(SSC)18,757 bp.


2.木蘭科物種葉綠體基因組比較分析

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3.IR邊界的收縮與擴張分析


比較30個物種的IR邊界區域,基因由彩色盒子表示,基因與邊界之間的間隙由堿基長度表示。


4.系統進化樹分析



30個物種的雙系統進化樹。線上數字表示每類的后驗概率,線下的數字表示步長值,右側的垂直線表示這些物種的亞屬分類位置。