幸运飞艇官方开户

服務熱線:025-85381280
文獻解讀

集思慧遠客戶發表《季也蒙畢赤酵母處理后梨的轉錄組學研究》

幸运飞艇官方开户FABURIQI:2019-03-17 LIULANCISHU:521

  摘要

  季也蒙畢赤酵母(M. guilliermondii)能顯著抑制貯藏梨的自然腐爛并對儲存品質無不良影響,同時還能誘導梨的抗性。通過和對照相比發現季也蒙畢赤酵母能顯著誘導一些抗性相關基因的表達,比如一些編碼苯丙氨酸解氨酶、過氧化物酶、β-1, 3葡聚糖酶的基因。此外,研究發現和空白對照0d相比接種季也蒙畢赤酵母的梨中葡聚糖酶表達水平上升105倍。這些研究表明季也蒙畢赤酵母能夠增強梨的抗性機制。接種3天后的梨和空白對照相比,檢測到144個顯著上調表達的基因(其中包括抗性相關的酶:類G蛋白偶聯受體1、類陽離子過氧化物酶1、類β葡聚糖酶12)。抗性相關的轉錄組因子WRKY9,WRKY31以及其他一些和發病機理相關的基因(Pyr c1,Pru ar 1-like,Pru av 1-like)也受到誘導。這些結論為拮抗酵母菌在梨中的生防機制提供新的研究基礎。


  材料方法

  沙梨品種:“Shuijing’’,所有梨都是均一大小隨機采集、成熟且無明顯損傷結痂;用0.1%次氯酸鈉消毒1min并用自來水清洗干凈,室溫風干。

  在所有梨的表面“赤道區域”挖出(5mm deep X 4mm diameter)規格相同的三個孔,對照:每個孔加入30ul無菌蒸餾水,處理:每個孔加入30ul季也蒙畢赤酵母懸浮液。所有樣品室溫條件風干2h并開始孵化(20℃,濕度:95%),孵化0(接種后2h)、1-5天,從孔的周圍取2g梨果實組織(切成砂漿狀、加入液氮研磨,提取總RNA),每種處理取3個生物學重復(共36樣品)。


  測序方案:Illumina HiSeq X Ten PE150,文庫(150-250bp),平均7.2G/sample。

  差異基因篩選標準:|log2 (Fold change)| ≥ 2,FDR < 0.05。

 定量PCR:Biorad CFX-96(內參:ACTIN)。


  研究結果

  各種生理指標檢測:腐爛速度、果實硬度及抗壞血酸含量在加入拮抗酵母后的樣品和對照間均有顯著差別,季也蒙畢赤酵母能顯著延緩果實的腐爛速率。


  2、季也蒙畢赤酵母對梨抗性基因表達的影響



  三種抗性相關基因(苯丙氨酸解氨酶、過氧化物酶、葡聚糖酶)在6個取樣時間點內處理和對照間均表現為差異表達。


  3、接種和對照間轉錄組測序數據分析

  處理和對照間共鑒定到381個差異基因,其中144個是處理組中上調表達的。差異基因GO注釋:細胞組分(細胞,細胞膜,細胞器),分子功能(催化活性,結合,植物激素信號轉導),生物學過程(代謝過程,細胞過程,單一生物過程,響應刺激,生物條件,信號)這些過程均與抗病性相關。


  KEGG通路富集分析:植物-病原菌互作(17%),植物激素信號轉導(15%)


  4、抗病相關基因RT-PCR驗證

  差異表達的抗性相關基因


  RT-PCR驗證結果表明RNA-seq分析得到各種抗病相關基因是真實差異表達的


  參考文獻

  Transcriptome characterization and expression profile of defense-related genes in pear induced by Meyerozyma guilliermondii[J] Postharvest Biology and Technology.2018.IF=3.248